Inkubační doba onemocnění je nejčastěji 1 - 5 let, ale pohybuje se od 3 měsíců do 20 let. Klasifikace onemocnění dle Ridleye a Joplinga: TYP LEPRY TUBERKULOSNÍ (paucibacilární, TT) a TYP LEPROMATOSNÍ (multibacilární, LL). Kromě toho se rozlišuje forma přechodná čili dimorfní nebo borderline, která je buď na rozhraní od obou předchozích typů, nebo se více blíží jednomu z vyhraněných typů. Konečně rozeznáváme formu indeterminovanou (I), t.j. dosud nevyhraněnou.
Pacienti s leprou

Popis: A - Obrázek pacienta s tuberkulosní leprou, B - Obrázek pacienta s lepromatosní leprou, C - Kontraktura prstů ruky u pacienta nemocného leprou.
Zdroj: Medscape Reference: Drugs, Diseases & Procedures. DARVIN SCOTT SMITH, MD, MSc, DTM&H. Infectious Diseases: Multimedia Library of Leprosy [online]. 07-06-2011 [cit. 2012-11-29]. Dostupné z: http://reference.medscape.com/features/slideshow/leprosy .
Manifestní forma lepry začíná obvykle jako forma indeterminovaná, která je charakterizovaná neostře ohraničenými makulami, obvykle hypopigmentovanými, někdy i erytematózními, kůže na nich ale není změněna. Je na nich obvykle porušena citlivost na teplo, později na dotek. Časem vzniká polyneuritida, ale k trofickým změnám dochází vzácně. Indeterminovaná lepra může po léta přetrvávat, může se spontánně vyhojit, ale když se neléčí, přechází někdy v některý z jiných typů.
Častým raným příznakem prodromálního období lepry je pocit suchosti sliznice nosní, který je vystřídán úpornou rýmou a opakujícím se krvácením, dále slabostí, bolestmi hlavy a spavostí. Tento stav bývá provázen zvýšenou teplotou, přechodnými paresteziemi, neuralgií, artralgií, lymfadenopatií a depresivními stavy.
Zvláštní formou onemocnění je primární neuritická lepra bez kožních lézí s postižením jednoho nebo více periferních nervů (nejčastěji n. ulnaris). Nejdříve zjistíme poruchy citlivosti, později se dostaví bolest, vzniká atrofie svalů, paréza a různé deformity.
U 30 - 50 % nemocných se vyvine tzv. erythema nodosum leprosum (ENL), jehož podstatou je tvorba a ukládání imunokomplexů. Typickými příznaky jsou horečka, únava a rychlý vznik bolestivých uzlů na různých místech těla.